Le Parc est caractérisé par une morphologie glaciaire : les glaciers rendent non seulement le paysage alpin suggestif mais influencent également l'ensemble de l'écosystème du Parc. La végétation est typique des zones alpine et subalpine : on trouve des forêts de mélèze et des prairies alpines, tandis que dans les zones non touchées par les glaciers, il existe une végétation de montagne typique avec des forêts d'hêtre et de sapin blanc densément peuplées.

La faune du parc, facilement observable lors des excursions, comprend des bouquetins, des chamois, des marmottes, des chevreuils, des tétras lyres et des lièvres, tous “supervisés” par des majestueuses aigles royales. Les frontières occidentales et nord-ouest du Parc vont le long de la ligne de partage des eaux qui sépare la Valsesia de la vallée de Gressoney, du territoire suisse et de la vallée Anzasca, tandis qu'à l'est, il touche la crête alpine du massif du Mont Rose. La zone protégée s'étend sur environ 6 500 hectares et occupe les têtes des vallées de Valsesia, Val Sermenza et Val Mastallone, touchant les communes d'Alagna, Rima, Carcoforo, Rimasco, Fobello et Rimella. L'entrée du Parc Naturel Alta Valsesia du côté d'Alagna se trouve au Piazzale dell’Acqua Bianca, accessible par une navette reliant le Piazzale del Wold (une route fermée à la circulation).